在未来时代，一艘巨大的飞船朝地球驶来。它静悄悄地悬浮在世界的上空，不断地朝大气中释放一团一团的孢子云。没过多久，孢子云覆盖了整个天空，按照这种速度，它很快就会遮住太阳了。在最后的几天中，这段时期被后人称作为“黎明期”。

当孢子云靠近空中的临界物质时，云朵纷纷坠落到地上，短短几天的工夫，孢子云已经障碍了街道的交通，污染了水源，空气变得越来越稀薄，人们不得不得不杀死家里的牲口，将尸体丢在野地里。这一段时间就是所谓的“黄昏期”，地球上的大多数高级生物都濒临灭绝或已经绝种了。

在“黎明期”阶段，人类并没有意识到危险的降临。虽然有接到入侵警报，世界各国的政府并没有意识到末日来临的速度是如此之快，所以他们的国民也跟着一起遭殃了。

只有一小部分人幸存下来，他们躲在密闭的地下室中，事先储备了大量的食物和氧气。七周后，孢子云逐渐消散、分解、溶入泥土中。地球似乎已经恢复了平静，虽然这只是暂时的。这就是主人公进入游戏的目的：你必须要将这颗星球上幸存的人类集合起来，找到事件的主因，如果有可能的话，还要对肇事者实施报复计划。